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NAMD软件团队成员来访中国科学院超级计算中心
文章来源:  |  发布时间:2011-11-14  |  【打印】 【关闭

 

2011年11月10日,应超级计算中心金钟博士之邀,来自著名分子模拟软件NAMD软件开发团队、美国伊利诺伊大学厄巴纳-香槟分校(University of Illinois at Urbana-Champaign,UIUC)物理系、Beckman研究所Klaus Schulten教授领导的理论与计算生物物理学研究组(Theoretical and Computational Biophysics Group)刘彦欣博士,中科院生物物理所研究员孙飞一行访问中科院计算机网络信息中心超级计算中心并举行座谈会。

来自网络中心、软件所、力学所、研究生院、理论物理所、化学所、生物物理所等多家院内从事相关单位的研究人员20余人参加座谈会。会上,金钟博士介绍了超级计算中心以及中心在服务、应用和研究方面取得的成果。随后,刘彦欣博士做了题为“Recent applications of NAMD in modern biophysical research”的学术报告。报告中详细介绍了NAMD软件的原理、功能、所用算法、特别是在高性能计算方面所取得的成功。并以蛋白质折叠的研究为例,讲解了NAMD软件在此类研究中发挥的重要作用。大家就NAMD使用中遇到的问题、使用NAMD可进行的生物计算研究等内容进行了热烈的讨论。

会议期间,刘彦欣博士一行饶有兴趣地参观了网络中心超级计算机房设施,良好的软硬件环境给大家留下了深刻的印象。会后,刘博士代表NAMD软件开发团队表达了与超算中心进一步开展合作的意愿,双方商定在程序开发和人才培养上更加深入地进行商讨,以推动高性能计算对于NAMD软件更广泛应用的支撑。

 

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